Ingénieur en Bioinformatique

Description du Poste

Les Missions

Nous recrutons un·e ingénieure / ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nucleus RNA-seq générées à partir d’un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence au sein d’un embryon aviaire.

L'Activité

Les missions principales incluront :
• Analyse et traitement des données single-nucleus.
• Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients humaines publiques ou des nouvelles données issues de collaborations.
• Application de méthodes bio-informatiques pour l’annotation cellulaire, l’identification de sous-populations, l’analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d’enrichissement en processus biologiques etc.
• Collaboration étroite avec les biologistes de l’équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses.
• Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité.
• Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques.

Votre Profil

Compétences

• Formation : Un Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, biostatistiques sera un atout. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nucleus est indispensable.
• Compétences techniques :
Expérience en programmation (R, Python) et en gestion de données. Maîtrise des outils d'analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA etc.).
• Qualités personnelles :
Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire.

Votre Environnement de Travail

• Contrat CDD de 6 mois renouvelable 6 mois

L'Ingénieur H/F sera intégré à une équipe comprenant 1 ingénieur Bio-informaticien, et sera environné d'autres expertises en analyse de données. L'unité est située au coeur du campus de Lyon-Est à proximité des transports en commun.

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 2521€ brut selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR5284-VALCAS-011 Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Les métiers de la recherche