Offre de thèse en modélisation mathématique de la morphogenèse des vertébrés

Description du Poste

Sujet De Thèse

La thèse porte sur le développement et l’analyse de modèles mathématiques multi-tissulaires de l’embryogenèse, basés notamment sur des systèmes d’EDP issus de la mécanique des fluides.

Les principaux objectifs seront :
-Développer et analyser des modèles mathématiques décrivant la dynamique et les interactions entre plusieurs tissus au cours du développement embryonnaire
-Étudier différentes questions d’analyse associées à ces modèles, notamment leur comportement qualitatif et l’influence des paramètres
– Mettre en œuvre des méthodes numériques adaptées aux systèmes considérés
– Mettre en place des méthodes permettant de relier les modèles aux données expérimentales et d’estimer certains paramètres du modèle
– Confronter les résultats théoriques et numériques aux données d’imagerie, en s’appuyant si nécessaire sur des outils de traitement d’images et d’apprentissage automatique

Compétences recherchées:
– Étudiant(e) issu(e) d’un Master 2 en mathématiques / mathématiques appliquées, avec une solide formation en analyse, équations aux dérivées partielles et méthodes numériques
– Bonnes compétences en calcul scientifique et en programmation, notamment en Python, Julia ou Matlab
– Intérêt marqué pour la modélisation mathématique et les approches interdisciplinaires, en particulier à l’interface avec la biologie
– Une première expérience en modélisation, ainsi que des connaissances en mécanique des milieux continus ou en apprentissage automatique, seront appréciées

La thèse s’inscrit dans le cadre du projet interdisciplinaire PREMMOVE (2025–2031), financé par le PEPR Maths-Vives.
Elle sera co-dirigée par Michèle Romanos (CR CNRS) et Simon Masnou (PR UCBL Lyon1).

Mots clés : morphogenèse, modélisation mathématique, équations aux dérivées partielles (EDP), analyse des EDP, simulation numérique, intelligence artificielle, analyse d’images.

Votre Environnement de Travail

La thèse sera réalisée à l’Institut Camille Jordan (ICJ, UMR 5208), sur le campus de la Doua à Villeurbanne, au sein de l’équipe Modélisation mathématique et calcul scientifique (MMCS).
La thèse bénéficiera ainsi d’un environnement particulièrement adapté aux problématiques de modélisation, d’analyse et de simulation développées dans le projet.

Contraintes et risques

Des déplacements fréquents à Toulouse sont prévus afin de favoriser les interactions avec les équipes du CBI et du LAAS.
Aucun risque particulier n’a été identifié.

Rémunération et avantages

Rémunération

La rémunération est de 2 300€ brut mensuel

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR5208-MICROM-001 Section(s) CN / Domaine de recherche Mathématiques et interactions des mathématiques

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

Le CNRS

Les métiers de la recherche